目前黏膜免疫包括口服（胃肠道，gastrointestinal tract，GI）和鼻腔免疫（上呼吸道）。在许多情况下，鼻腔免疫更为有效，所需的疫苗量和佐剂量一般较小，且可以靶向病原体侵入的天然门户，同时避免了胃肠道的酸性环境及酶的作用对抗原的破坏，鼻腔内含有丰富的血管，故鼻腔接种既能产生黏膜免疫，又能产生系统免疫。同时，由于大多数病原体的感染发生在胃肠道、呼吸道及生殖道等黏膜表面，因共同黏膜免疫系统的存在，鼻黏膜又是该系统的重要组成部分，鼻黏膜免疫可在远距离黏膜部位产生免疫反应，起到抗黏膜感染的作用。